Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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