Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM28Q13263 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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