Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CBX3Q13185 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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