Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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