Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms