Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC10A2Q12908 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms