Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CNTN1Q12860 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CNTN1Q12860 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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