Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.7 ms