Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms