Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIN1Q05586 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms