Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBE1Q04446 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms