Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms