Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms