Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms