Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms