Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms