Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms