Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RWDD2BP57060 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RWDD2BP57060 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms