Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms