Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms