Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB28P51157 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB28P51157 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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