Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms