Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms