Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms