Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBRP36941 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms