Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJA4P35212 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms