Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms