Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms