Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IL3RAP26951 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms