Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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