Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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