Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms