Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDCP19113 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDCP19113 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDCP19113 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDCP19113 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDCP19113 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDCP19113 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms