Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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