Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DESP17661 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DESP17661 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DESP17661 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms