Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VEGFAP15692 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms