Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHAP12694 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms