Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms