Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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