Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GLI1P08151 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GLI1P08151 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GLI1P08151 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms