Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VTNP04004 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VTNP04004 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms