Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms