Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms