Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NBNO60934 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NBNO60934 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NBNO60934 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms