Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DUX1O43812 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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DUX1O43812 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DUX1O43812 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUX1O43812 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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