Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COCHO43405 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms