Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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