Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF10AO00220 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF10AO00220 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms