Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms