Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms